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全基因组重测序



技术简介:

全基因组重测序 (Whole-genome sequencing,WGS)是全面分析基因组的方法。新一代测序高通量和低成本的特点,为研究人个体或群体全基因组提供了平台。基于WGS技术的疾病研究显示,非编码区的DNA变异与复杂疾病起因有很大关联。

技术流程:


全基因组重测序


优势:

1、癌症多组学分析流程

涵盖基因组、转录组及表观组三大组学

2、丰富的临床转化经验

东极血液病临床转化

3、丰富的项目经验

项目合作1200+

4、关注临床学前沿研究成果

癌症/疾病医学报告、新生抗原预测

5、高通量测序平台

lllumina NovaSeq 6000、lllumina HiSeq XTen、MGI DNBSEQ-T7


技术要求


全基因组重测序

全基因组重测序需注意以下事项:

样本质量:确保 DNA 浓度≥50ng/μL,总量≥2μg,纯度 OD260/280 在 1.8-2.0 之间,无严重降解(电泳检测主带清晰),避免 RNA、蛋白污染,样本需低温运输(干冰或冰袋)并做好标识。

测序策略:根据研究目的选择测序深度(如人类疾病研究常选 30×-50×),全基因组重测序一般采用 Illumina 等高通量测序平台,配对末端测序(PE150/PE180)可提升拼接准确性。

数据分析:提前明确分析需求(如 SNP/InDel 检测、结构变异分析等),选择合适参考基因组(如人类 GRCh38),注意分析流程的可靠性(如 BWA 比对、GATK 变异检测),同时关注数据存储与隐私保护(尤其涉及人类样本时)。

实验设计:若为群体研究,需合理设置对照组,减少个体差异干扰;技术重复可提升数据可信度,且需在测序前与服务方确认建库方案(如是否去核糖体、片段大小选择)。


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