简介
单细胞水平的高通量基因表达谱分析,对复杂细胞群体深入分析,表征单个细胞的表达谱。
可同时检测CRISPR干扰、细胞表面蛋白,避免单个细胞的异质性生物学信息被大量细胞的均质化掩盖。
技术优势
1、不需要微量扩增,降低假阳性率;
2、真正的单细胞水平测序,Doubletrate:0.9%/1000个细胞;
3、灵活的获取量,可一次性对100~80000个细胞建库,提高效率;
4、7分钟之内即可完成单细胞体系制备,捕获效率高达65%;
5、广泛的研究应用领域,超短的项目周期。
10x Genomics 单细胞转录组测序注意事项
样本制备:样本需保持新鲜、活性高,避免反复冻融。组织解离过程中,严格控制酶解时间和温度,防止过度消化或细胞团聚,单细胞悬液浓度应控制在 700-1200 cells/μL,活细胞比例需高于 80%,且无细胞碎片和死细胞污染。
实验操作:严格按照 10x Genomics 标准流程操作,注意试剂保存条件与使用期限,避免气泡产生影响微流体系统运行。进行油包水反应时,精确控制各组分比例,确保每个 GEMs(凝胶珠乳液)仅包裹单个细胞。
数据分析:选择适配的分析工具(如 Cell Ranger、Seurat),合理设置参数(如预期细胞数)。由于数据量大,需足够的计算资源和存储容量。同时,根据实验目的筛选关键细胞亚群,关注批次效应,必要时进行数据整合与标准化处理。
以上涵盖了 10x Genomics 单细胞转录组测序的关键要点。若你还想了解某一环节的详细内容,或有其他需求,欢迎随时告知。